नेपालमा बजेट कार्यान्वयनको एउटा प्रमुख चुनौती भनेको लक्ष्यअनुसारको विकास खर्च कसरी गर्ने भन्ने हो । विगत लामो समयदेखि सरकारले विनियोजन गरेअनुसारको पुँजीगत बजेट खर्च हुन नसकिरहेको अवस्था हामीले देखेकै छौं । लक्षित रकम खर्च गर्न नसके कार्य सम्पादन नै कमजोर मानिने हाम्रो जस्तो प्रणालीमा समेत विनियोजन भएको रकम खर्र्च गर्न नसक्नु चिन्ताको विषय हो ।